Organi Združenja SOCIALNA EKONOMIJA SLOVENIJE, so.p. so:
- skupščina
- upravni odbor
- generalni sekretar
- nadzorni odbor
- strokovni odbor
Skupščino kot najvišji organ sestavljajo vsi člani, ki se sestanejo najmanj enkrat letno, z namenom, da odločajo o najpomembnejših postopkih za delovanje združenja.
Upravni odbor: Iris Magajna, Mojca Žganec Metelko, Mitja Bogataj, Miro Mihec, Sebastjan Pikl.
Uradna zastopnica: Mirjana Ivanuša Bezjak